La genética tiene un enorme peso en la aparición de autismo. La recurrencia en varios miembros de una familia, con especial coincidencia en gemelos idénticos, y el hecho de que afecte más a hombres que a mujeres ponen a los factores genéticos en la primera linea de la sospecha.

El neurodesarrollo es muy complejo, con todos esos genes indicando y dirigiendo los acontecimientos. La expresión del genoma determina qué pasa, donde pasa y cuando pasa, sigue un patrón temporo-espacial muy preciso. Es fácil comprender que cualquier interferencia suficientemente desestabilizadora va a causar una alteración en la expresión genética y por tanto puede alterar el normal desarrollo cerebral.